Pereiti prie turinio
ieškoti
TiFEC 2025

Tarptautiniuose mokymuose – dėmesys pažangiems bioinformatikos metodams

Rugsėjo 28–30 d. Technologinių ir fizinių mokslų ekscelencijos centro (TiFEC) jaunoji mokslininkė dr. Sigita Jeznienė dalyvavo Madride (Ispanija) vykusiuose tarptautiniuose bioinformatikos mokymuose „Third INFOGUT Training School: Bioinformatics 101 for Colon Model Experiments“. COST asociacijos (veikla „InfoGut CA23110“) ir IMDEA Nutrition instituto organizuoti mokymai suteikė galimybę pagilinti moksliniams tyrimams reikalingas kompetencijas ir susipažinti su pažangiais duomenų analizės metodais.

Mokymuose daugiausia dėmesio skirta mikrobiomo ir metabolomikos duomenų, gaunamų naudojant in vitro virškinimo modelius, analizei. Dalyviai gilino programavimo, statistinės analizės ir duomenų valdymo įgūdžius, praktiškai dirbo su R programavimo kalba, „Bash“ komandine eilute ir „GitHub“ platforma, susipažino su FAIR duomenų principais.

„Mokymuose ne tik pagilinau bioinformatikos ir programavimo žinias, bet ir susipažinau su „GitHub“ platforma, sužinojau, kaip patogiai talpinti, tvarkyti ir dalytis programiniu kodu, sekti jo pakeitimus bei užtikrinti sklandesnį bendradarbiavimą su kitais tyrėjais“, – pasakoja dr. S. Jeznienė.

Įgytos žinios tiesiogiai siejasi su mokslininkės vykdomais tyrimais. Kartu su „Maisto struktūrų tyrimo ir projektavimo“ mokslo grupės kolegėmis ji dirba su in vitro virškinimo ir SHIME modeliais, analizuoja žarnyno mikrobiomo sudėties bei aktyvumo pokyčius. Šių tyrimų metu gaunami dideli ir sudėtingi duomenų rinkiniai, kuriems apdoroti ir interpretuoti reikalingi pažangūs analizės metodai.

„Mokymuose įgytos bioinformatikos, statistinės analizės ir duomenų valdymo žinios bus ypač naudingos. Jos padės ne tik efektyviau apdoroti ir analizuoti duomenis, tačiau ir patikimiau interpretuoti gautus rezultatus bei užtikrinti tyrimų atkartojamumą“, – teigia tyrėja.

Pasak dr. S. Jeznienės, mokymuose įgytos žinios bus naudingos ir TiFEC mokslinėje veikloje – padės geriau planuoti eksperimentus, užtikrinti patikimesnę duomenų analizę ir rezultatų atkartojamumą. Šios kompetencijos taip pat svarbios rengiant mokslines publikacijas, plėtojant tarpdisciplininius projektus ir bendradarbiaujant su kitomis institucijomis.

Projektą „Technologinių ir fizinių mokslų ekscelencijos centras (TiFEC)“ Nr. S-A-UEI-23-1 finansuoja Lietuvos mokslo taryba ir Lietuvos Respublikos švietimo, mokslo ir sporto ministerija valstybės biudžeto lėšomis pagal programą „Universitetų ekscelencijos iniciatyva“.